Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJI4

Pou6f2, POU domain, class 6, transcription factor 2, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f2Q8BJI4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pou6f2Q8BJI4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pou6f2Q8BJI4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pou6f2Q8BJI4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pou6f2Q8BJI4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f2Q8BJI4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pou6f2Q8BJI4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pou6f2Q8BJI4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pou6f2Q8BJI4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pou6f2Q8BJI4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f2Q8BJI4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pou6f2Q8BJI4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms