Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn3Q8BHH8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms