Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4dQ8BGV9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms