Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
U2af1l4Q8BGJ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms