Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8BGC1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8BGC1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8BGC1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms