Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpped1Q8BFS6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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