Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms