Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cracr2bQ80ZJ8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms