Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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