Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms