Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrfn4Q80XU8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrfn4Q80XU8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrfn4Q80XU8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrfn4Q80XU8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrfn4Q80XU8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrfn4Q80XU8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms