Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thnsl2Q80W22 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms