Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc29Q80VM3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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