Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms