Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf7ipQ7TT18 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms