Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms