Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp6r1Q7TSI3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms