Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms