Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPW1

Nexn, Nexilin, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexnQ7TPW1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NexnQ7TPW1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.33■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NexnQ7TPW1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms