Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShprhQ7TPQ3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShprhQ7TPQ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms