Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim17Q7TPM3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms