Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp397Q7TNK4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms