Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmc8Q7TN58 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms