Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms