Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6aQ78XR0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6aQ78XR0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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