Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sys1Q78S06 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sys1Q78S06 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms