Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms