Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme8Q715T0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms