Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SynmQ70IV5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms