Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms