Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms