Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rhox8Q6VSS7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rhox8Q6VSS7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms