Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms