Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Atp8b3Q6UQ17 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Atp8b3Q6UQ17 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Atp8b3Q6UQ17 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Atp8b3Q6UQ17 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Atp8b3Q6UQ17 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Atp8b3Q6UQ17 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Atp8b3Q6UQ17 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Atp8b3Q6UQ17 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Atp8b3Q6UQ17 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Atp8b3Q6UQ17 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Atp8b3Q6UQ17 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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