Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300aQ6SJQ0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300aQ6SJQ0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms