Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms