Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gramd2bQ6PEM6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms