Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp40Q6PE01 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrnp40Q6PE01 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms