Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd4Q6PDQ2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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