Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms