Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhb9Q6PB60 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms