Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd3Q6P9Z1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcd3Q6P9Z1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms