Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp12Q6P5B0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms