Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp200Q6P4T2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms