Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms