Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig3Q6P1C6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms