Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms