Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms