Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms