Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ltv1Q6NSQ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms